Балтийский филиал Пушкинского музея (Государственного центра современного искусства) — единственный государственный музей в Калининградской области, который специализируется на современном искусстве.

Его проекты неоднократно входили в шорт-лист ежегодной российской премии в области современного искусства «Инновация» (Москва): «9 000 км» (куратор — Евгений Уманский), «Арт-гид. Кенигсберг/Калининград сегодня» (куратор — Елена Цветаева), социокультурный проект «Художник и оружие» (куратор — Евгений Уманский).

Балтийский филиал трижды становился обладателем премии «Инновация»: в 2009 году проект «Эволюция от кутюр. Искусство и наука в эпоху постбиологии» (кураторы — Дмитрий Булатов и Олег Блябляс) стал победителем в номинации «Региональный проект современного искусства», в 2011 году в этой же номинации ее получил совместный с ЦСИ «Уяздовский замок» (Варшава, Польша) проект «Анклав» (кураторы БФ ГЦСИ — Ирина Чеснокова и Евгений Уманский).

В 2014 году куратор учреждения Дмитрий Булатов получил «Инновацию» в номинации «Теория, критика, искусствознание» за второй том антологии «Эволюция от кутюр: Искусство и наука в эпоху постбиологии». В 2005 году видеоинсталляция Юрия Васильева «Роща» (Russian Red project, куратор — Евгений Уманский) выиграла конкурс «Меняющийся музей в меняющемся мире» на лучшее воплощение образа России.

С 2020 года является Балтийским филиалом Пушкинского музея. В декабре 2022 открылось выставочное пространство филиала.